Если документы загружаете в 1с через блок Маркетплейсы и комиссионеры, то проводка по взаимозачёту (ДТ 60 КТ 76.09) создаётся автоматически в документе Поступление услуг.
Если заносите документы через раздел Покупки, то для взаимозачёта используете документ Корректировка долга.