Вам нужно понимать, откуда остатки (может, они обоснованны из-за перплаты). сверяться в ЛК с расчетами налоговой. и делать своевременно Корректировки ЕНС (если пени или налог корректируете) и Сведения об уплате налогов (то, что по р/с прошло). это в 1с бухгалтерия
не то что прошло по р/с а те суммы, которые были зачётны в уплату того или иного налога на ЕНС. А пени также можно начислять с помощью бух. Справки (с остака енс по данным по операциям по ЕНС). Это легко делать путем выгрузки с ЕНС в ексель данных об операциях по ЕНС. Потому что сальдо на ЕНС (если оно положительное) это есть ничто иное как дебиторская задолженность, т е актив